最终在柳州遇到从河南来全力支持的元军阻击，中路红巾军又攻击保定不克，没能完成两路夹击计划，毛贵只能败退回山东。而中路红巾军攻击保定不克以后，挥军攻克山西大同，经大同出塞直插蒙古草原，开始历史上气势恢宏的征程。
这路军队曾经占领并火烧蒙元上都，攻陷辽阳，两次攻入朝鲜，最后在恶劣的天气和元军及其藩属朝鲜军的前后夹击下失败。不过这次沈飞会在关键时候出手援助，改变他们的悲剧结局，让这个位面的后世流传他们的壮举。
毛贵退回山东以后，接下来就会发生内讧夺权火拼事件，毛贵在宴席上被他的老上级赵均用杀害，后来毛贵的下属续继组又杀了赵均用报仇，红巾军陷入内讧。察罕特穆尔趁机进军山东，攻陷济南，红巾军阵亡两万多人，田丰、王士诚战败诈降，后来寻机行刺杀了察罕特穆尔。之后王保保（扩廓帖木儿）被推举为首领，率军攻占益都杀了田丰和王士诚。
巩昌之战虽然大败元军骑兵，不过察罕特穆所部人马并没有伤筋动骨，损失最大的还是其他的其他几支人马，脱伯列和另一个汉奸军阀张良弼更是被沈飞的弹指神通顺手飞石干掉。现在察罕特穆正在集结兵力打算对山东红巾军动手，毕竟只有这支人马攻击过大都，对元庭威胁最大。
对于山东红巾军，沈飞犹豫过，要不要保毛贵，是不是也学元军趁红巾军陷入内讧群龙无首时出击收拾残局？最后决定可以利用内讧夺权，不过毛贵有功，命还是要保的。在情报司的暗中运作下，把赵均用的老上级芝麻李安排过去调解。
因为脱脱事先被干掉，没有徐州屠城事件，芝麻李等人也都没死，只是在后来的战争时因为能力不足，影响力被之后脱颖而出的将领超过，不过毕竟是资历深厚的元老，让他先出面说和一下再下手更加顺理成章。根据情报司搜集的情报，赵均用野心极大，连彭莹玉都不放在眼里，何况是芝麻这个过气的前上司。
事情也正如所料，半个月以后，赵均用设下鸿门宴，在宴会上动手要杀毛贵夺取他麾下兵力，出席宴会的芝麻李劝阻赵均用无效，反而被大骂一顿。在潜伏成毛贵护卫的情报司高手插手下，毛贵只是受了些伤逃脱，躲进了附近情报司产业控制的安全屋里。
消息迅速在山东传开，有芝麻李的证言，一时群情激愤，毛贵手下迅速来援，还是和赵均用手下发生火拼。山东毕竟是毛贵经营两年的地盘，即使失踪养伤，手下实力也远不是赵均用能比，一场大战下来，赵均用手下全部覆灭，他本人还是被续继组所杀。
还没等山东乱局平息，察罕特穆尔率军五万杀进山东，在情报司运作过山东红巾军放弃东平，一路撤往益都。同时在安徽、江苏早已经准备好集结的兵力迅速出击，韩山童、杨三姑夫妻和常遇春三大亲传弟子率领骑兵一万骑兵进军山东，张定边和李兰茵率领六个车营押后，在益都城下双方主力相遇，大战了一场。
这一战是红巾军重甲骑兵第一次登场，一人双马和察罕特穆尔骑兵来了一次火星撞地球式的碰撞，戚继光发明的一种武器“快枪”也第一次出现在战场上，快枪是冷热两用兵器，只能发射一次弹丸的步枪，射击完以后枪管前装上一个钢制枪头就当长枪使用。
韩山童和常遇春的武器都是春秋大刀，如关羽重现。此战中表现最出彩的是杨三姑，这与她使用的兵器有关，她使用是一杆长枪，使出破阵枪法在战场上往来纵横无敌，连杀二十多个元军，和常遇春先后在战场上顺利破入了丹劲。
益都就是宋朝的青州，姓杨、身披红巾，枪法如神，这些加起来都让人想起百年前的梨花枪无敌手杨妙真，杨三姑算是借了古人的名声风头大振。半个月大战和察罕特穆儿的骑兵打出了一比三的交换比，车营起到后合围歼灭了六成元军，张定边和李兰茵也破入丹劲，战场确实是最适合锻炼武艺，缴获战马一万三千多匹，超过了损失三倍多，察罕特穆尔仅带两万人马撤出了山东。
这时毛贵虽然已经清醒过来，不过还需要修养难以管事，吴国公沈飞部先是在内讧中救了毛贵的命，又在元军杀入是挥军救援，一场大捷下来大大提升了威望，逐渐接收了山东地盘。毛贵即使不满也无力阻止。
拿下山东以后，军管和各项产业也迅速跟进铺开，矿业、军工、商业、情报，因为山东靠海，最重要的两条是晒盐和造船业，从南方抽调工匠和水师北上，在登州（烟台）、胶州（青岛）、益都（威海）建立起大型造船和水师基地。
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